使用DeepSeek可轻松完成方差分析?
任务完成后,下载分析结果,结果文件夹中主要包含5个文件,其中“anova.result.xls”为分析结果文件,用户可以查看详细的Bartlett test方差齐性检验、单因素方差分析(one-way ANOVA)、Tukey’s HSD (honest significant difference)结果表格,如下图,表格的前两列为比较组,第3列为p value,第4列为显著性标记。鉴于DeepS
1、上传分析数据
将示例数据文件直接复制粘贴到对话框中即可上传文件,当然也可点击“曲别针”上传附件。注:DeepSeek支持Excel文件、制表符分隔的文本文件等,范例数据可直接使用OmicShare方差分析工具的示例文件
DeepSeek官方链接:https://www.deepseek.com/
然后,输入指令:“提取附件中的数据表格,命名为tab.1,并展示附件中的表格”,结果如下。
确认上传的数据没问题后,继续输入指令:“对上文tab.1中6列数据进行统计分析,以表格的方式总和、均值、标准差、标准误和观察值数,给出相应的R语言分析代码,并进行结果验证”。
给出的描述性统计分析结果如下:
在分析结果中,其实还给出了完成上述统计分析对应的R语言代码,如下图,这样我们就可以复制R代码,在Rstudio中进行分析结果的验证。
点击以上代码块右上角的“复制”按钮,然后将DeepSeek生成的代码复制粘贴到Rstudio的教本编辑器中进行运行,分析结果如下图。
与上文DeepSeeK给出的结果相比,单从求和这一列数据就可以看出,分析结果还是有偏差的!多次尝试后,甚至用DeepSeeK给出的Python代码进行验证,最终发现DeepSeek给出的代码没问题,但是比较诡异的是DeepSeek直接给出的结果却有偏差!
2、单因素方差分析
继续输入指令:“对 tab.1 中的6列数据进行单因素方差分析和并使用Tukey’s HSD法对均值进行多重比较,以表格的方式给出差异分析结果”,进行方差分析。
分析结果如下:
从分析结果可见,NK-B、pDC-B、pDC-NK三个比较组的差异分析结果不显著。鉴于DeepSeek直接给出结果存在“偏差”,这里继续复制给出的方差分析部分R代码,在Rstudio中进行分析验证。
分析结果如下,可以看出NK-B、pDC-B、pDC-NK三个比较组的差异分析结果不显著,与上文DeepSeek给出的结果一致。
3、分析结果验证
OmicShare的方差分析工具,支持Bartlett test方差齐性检验、单因素方差分析(one-way ANOVA),同时提供Fisher’s LSD(Least Significant Difference)、Tukey’s HSD (honest significant difference)、Games-Howell 3种多重比较方法供大家选择。
如果对DeepSeek的分析结果不确信,也可以通过OmicShare使用同样的数据进行验证,均值比较方法同样选择Tukey’s HSD,如下图。
工具链接:https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/anova
任务完成后,下载分析结果,结果文件夹中主要包含5个文件,其中“anova.result.xls”为分析结果文件,用户可以查看详细的Bartlett test方差齐性检验、单因素方差分析(one-way ANOVA)、Tukey’s HSD (honest significant difference)结果表格,如下图,表格的前两列为比较组,第3列为p value,第4列为显著性标记。同样,多重比较结果也以字母标记的方式呈现,表格中主要是均值(mean)、标准差(sd)和字母标记(cld)。
结果文件中也包含一个柱状图,柱状图的字母显著标记也可以直观展示组间的差异显著性(如下图),两个分组的标记中包含相同的字母,表示差异不显著(例如NK组、B组和pDC组);而两个分组的标记中无相同的字母,表示差异显著(例如Activated_T组、B组、HSC组和Naive_T组)。
综上,通过比较OmicShare和DeepSeek的方差分析结果,可以发现OmicShare与DeepSeek给出R代码的分析结果完全一样,但DeepSeek直接给出的统计结果却存在偏差。因此,当前大家在使用DeepSeek进行统计分析时,注意使用其给出的分析代码或其他分析工具进行相互验证。
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