
科研绘图小白速看!【ChatGPT、DeepSeek+R语言科研绘图】AI赋能科研绘图与数据可视化(如何画图、如何标注、如何改图、如何美化、如何组合、如何排序来分解科研绘图)技术路线图
【ChatGPT+DeepSeek科研绘图】AI赋能科研绘图与数据可视化(如何画图、如何标注、如何改图、如何美化、如何组合、如何排序来分解科研绘图)技术路线图
R 语言 是数据分析和可视化的强大工具,尤其在科研领域,R 的绘图功能被广泛使用。R 提供了多种绘图包,能够生成高质量的统计图形。
在 R 语言中,有多种绘图方式,下面为你详细介绍基础绘图函数和ggplot2
包绘图的常见用法及示例。
基础绘图函数
R 语言自带了许多基础绘图函数,如plot()
、hist()
、boxplot()
等,以下是几种常见图形的绘制示例。
1. 散点图
散点图用于展示两个变量之间的关系。
R
# 生成随机数据
x <- rnorm(50)
y <- rnorm(50)
# 绘制散点图
plot(x, y, main = "散点图", xlab = "X轴", ylab = "Y轴", col = "blue", pch = 16)
main
:设置图形的标题。xlab
和ylab
:分别设置 X 轴和 Y 轴的标签。col
:设置点的颜色。pch
:设置点的形状。
2. 折线图
折线图常用于展示数据随时间或其他连续变量的变化趋势。
R
# 生成随机数据
x <- 1:10
y <- rnorm(10)
# 绘制折线图
plot(x, y, type = "l", main = "折线图", xlab = "X轴", ylab = "Y轴", col = "red")
type = "l"
:指定绘制折线图,l
表示线条。
3. 直方图
直方图用于展示数据的分布情况。
R
# 生成随机数据
data <- rnorm(100)
# 绘制直方图
hist(data, main = "直方图", xlab = "数据值", ylab = "频数", col = "green")
4. 箱线图
箱线图可以展示数据的中位数、四分位数、异常值等信息。
R
# 生成随机数据
group1 <- rnorm(50)
group2 <- rnorm(50, mean = 2)
# 绘制箱线图
boxplot(group1, group2, names = c("组1", "组2"), main = "箱线图", ylab = "数值")
names
:设置每个箱体的名称。
使用ggplot2
包绘图
ggplot2
是一个强大的绘图包,它基于图形语法,提供了更加灵活和美观的绘图方式。
1. 安装和加载ggplot2
包
R
# 安装包
install.packages("ggplot2")
# 加载包
library(ggplot2)
2. 散点图
R
# 创建数据框
df <- data.frame(x = rnorm(50), y = rnorm(50))
# 绘制散点图
ggplot(df, aes(x = x, y = y)) +
geom_point(colour = "blue", size = 2) +
labs(title = "ggplot2散点图", x = "X轴", y = "Y轴")
ggplot()
:初始化一个绘图对象。aes()
:设置图形的美学映射,如x
和y
变量。geom_point()
:添加散点图层。labs()
:设置图形的标题、X 轴和 Y 轴标签。
3. 折线图
R
# 创建数据框
df <- data.frame(x = 1:10, y = rnorm(10))
# 绘制折线图
ggplot(df, aes(x = x, y = y)) +
geom_line(colour = "red", size = 1) +
labs(title = "ggplot2折线图", x = "X轴", y = "Y轴")
geom_line()
:添加折线图层。
4. 直方图
R
# 创建数据框
df <- data.frame(value = rnorm(100))
# 绘制直方图
ggplot(df, aes(x = value)) +
geom_histogram(bins = 10, fill = "green", colour = "black") +
labs(title = "ggplot2直方图", x = "数据值", y = "频数")
geom_histogram()
:添加直方图图层。bins
:设置直方图的组数。
5. 箱线图
R
# 创建数据框
df <- data.frame(group = factor(rep(c("组1", "组2"), each = 50)),
value = c(rnorm(50), rnorm(50, mean = 2)))
# 绘制箱线图
ggplot(df, aes(x = group, y = value)) +
geom_boxplot() +
labs(title = "ggplot2箱线图", x = "组", y = "数值")
geom_boxplot()
:添加箱线图图层。
R 语言的绘图功能强大且灵活,能够满足科研中的各种可视化需求。
在科研成果竞争日益激烈的当下,「一图胜千言」已成为高水平SCI期刊的硬性门槛——数据显示很多情况的拒稿与图表质量直接相关。科研人员普遍面临的工具效率低、设计规范缺失、多维数据呈现难等痛点,因此科研绘图已成为成果撰写中的至关重要的一个环节,它不仅帮助研究者更直观地展示实验数据,还能有效传递研究成果的深刻含义,也是高水平SCI论文的数据可视化的重要形式。
第一章、绘图原则与概念:规范清晰简洁自明
1、科研绘图的基本原则与概念
2、绘图的简洁性、一致性、准确性、自明性
3、图形的基本元素(尺寸、格式、分辨率、字体、配色、高分论文案例)
第二章、R绘图系统:八仙过海各显神通
1、R语言的基本用法和数据处理
2、R语言的做图系统
(1)Rbase基础绘图系统:基础图形函数(plot、lines、points等)
(2)ggplot2系统:层次化绘图理念,主题设计与自定义
(3)lattice系统:多面板图形与条件绘图
(4)plotly系统:交互式图表绘制与3D图形应用
3. DeepSeek和chatGPT支持下的科研绘图
第三章、美学设计与细节:完美图表华丽呈现
3. 图表的美学与设计
1. 配色方案
2. 标题
3. 坐标轴设计
4. 图例:清晰标注图例位置与内容
5. 字体:字体大小、类型与间距的选择
6. 线条:线条的粗细、样式选择及其与背景的对比
7. 背景:透明或简洁背景设计,提高视觉清晰度
第四章、数据类型与图表:宝典在手各个击破
1. 常见数据格式:如何识别数据类型,选择适当图表
2. 科研绘图全类型绘制
2)散点图、气泡图:适合显示两组数据关系
3)折线图、柱状图:趋势分析与比较
4)箱线图、小提琴图:数据分布分析
5)云雨图、直方图、密度图:数据分布的不同展示方法
6)饼图、雷达图、玫瑰图:比例关系与环形展示
7)热力图、聚类热图、相关矩阵图:数据相似性展示
8)瀑布图、条形图、面积图:时间序列或分布展示
9)堆积图、桑基图:展示流动与比例
10)词云图、关联图:文本数据与关系网络
11)环形图、和弦图:比例与结构关系
12)生存曲线图、漏斗图:生物医学与临床数据分析
13)森林图、韦恩图、upset图:元分析与交集分析
14)UMAP图、函数曲线图:降维与函数关系展示
15)箱线密度图、神经网络图:机器学习与深度学习数据展示
16)ROC图、火山图:分类模型与生物学数据可视化
17)环形热图、公式图:其他特殊类型的应用
第五章、统计分析与可视化:精确数据尽在图中
1. 图表中的统计与分析
1)基本统计:均值、标准差、置信区间、t检验、方差分析
2)回归分析与主成分分析:如何展示线性与非线性关系
3)p值与信号:如何标注统计显著性
4)RMSE与R²:图中显示回归模型评估指标RMSE、R2等
5)注释与细节:如何通过注释和细节增强图表的可解释性
第六章、地理空间与GIS:地理数据鲜活地图
1. 地理信息系统(GIS)与地理空间分布绘图
1)GIS简介:地理空间数据与GIS工具的应用
2)空间分布图绘制:地图可视化,热力图与点图
3)地理数据处理与可视化:如何处理地理坐标与绘图
4)实践应用:地理数据的实际案例分析
第七章、GIF制作与展示:图形动态活灵活现
1. GIF动图的绘制
2. 审稿意见的常见问题及处理
1)动图制作原理:如何通过GIF展示数据变化
2)R与其他工具的动图生成:gganimate、plotly等
3)动图的应用场景与注意事项
第八章、多图合成与排版:高效布局子刊密码
1. 多图合成与高级排版
1)组图系统:如何在一张页面中合理组合多个图表
2)高级排版技巧:排版美学与信息传达的平衡
3)制作长文图表:如何制作长条形图、时间轴等特殊排版
4)实践应用:结合案例进行多图合成与排版练习
第九章、技术路线与流程:概念生动逻辑清晰
1. 技术路线图绘制
1)技术路线图的概念与应用:科研工作流程与技术路线
2)图表设计原则:如何通过图表表达技术流程与进展
3)实践应用:技术路线图绘制的具体案例
2. 概念图绘制
1)AI绘图:如何使用AI绘制概念图
2)神经网络概念图:如何使用AI辅助绘图,制作神经网络与机器学习流程图
3)图形摘要的绘制:如何通过简洁明了的图形总结研究核心
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