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前言

利用deepseek制定学习计划,从0开始学习生物信息学,向AI生物信息方向发展,今后希望可以按照这个计划坚持下来,看最后结果是怎样。


一、用deepseek-r1制定学习计划?

提示词1:我本科是XX专业,硕士是林木遗传育种方向,主攻课题为基因定位,毕业后在市政绿化行业工作两年,目前已离职,目前想向AI行业或者机器人行业转行,请问有什么好的建议和规划吗?
提示词2:我计划用4周的时间,达到可以胜任生命科技公司AI部门(如华大基因、药明康德AI部门)的工作能力,请帮我列出详细的学习计划,并做成表格

二、使用步骤

1.提示词1后deepseek给出的回答:

根据你的背景和转行目标,以下是分阶段的详细规划建议:

一、核心优势定位

复合型知识结构:生物信息学(基因定位)+ 环境工程(市政绿化)+ AI/机器人
差异化竞争力:聚焦「生命科学×智能科技」交叉领域
可迁移技能:实验设计、数据分析、统计学应用、项目管理
二、AI领域转行路径
阶段1:基础建设(3-6个月)

编程基础:Python(NumPy/Pandas)+ SQL + Linux
数学补强:重点突破概率统计与线性代数
机器学习:吴恩达课程+《Hands-On ML》+ Kaggle入门
阶段2:垂直领域突破

生物信息学方向:
掌握Biopython/BCL等工具
参与基因组数据分析项目
学习AlphaFold等AI制药前沿
智慧农业方向:
研究精准农业中的CV应用
探索植物表型组学AI分析
开发生长预测模型
阶段3:实战验证

开发植物病害识别系统(CV应用)
构建基因型-表型预测模型
参加Kaggle生物数据竞赛
三、机器人领域转行路径
阶段1:知识重构(4-8个月)

基础课:自动控制原理+ROS系统
硬件基础:Arduino/树莓派开发
核心技能:SLAM导航+OpenCV
阶段2:场景化专精

农业机器人方向:
研究自动嫁接机器人
开发智能喷药系统
设计苗圃巡检机器人
生态机器人方向:
城市绿化监测无人机
自动修剪机器人
土壤分析机器人
阶段3:项目沉淀

搭建自动灌溉原型系统
改造开源农业机器人项目
参加RoboMaster等赛事
四、求职策略

目标企业类型:

生命科技公司(华大基因、药明康德AI部门)
农业科技企业(极飞科技、大疆农业)
智慧城市解决方案商
科研院所交叉学科组
简历优化重点:

突出多学科交叉背景
量化市政绿化项目成果
展示自主学习能力(GitHub/技术博客)
过渡期建议:

争取生物信息分析岗位作为跳板
参与智慧农业初创公司项目
报考农业/林业院校AI相关在职博士
五、风险控制

建立「双线发展」模式:保持原有领域深度同时拓展技术宽度
考取权威认证:AWS机器学习认证/NVIDIA DLI证书
加入垂直社群:AgFunder/农业机器人开发者联盟
建议优先考虑AI在生命科学领域的应用方向,你的基因研究背景可产生独特优势。当前农业AI人才缺口达67%(2023年工信部数据),且存在专业壁垒,是理想的转行切入点。初期可瞄准智慧农业企业的算法工程师岗位,逐步向核心AI岗位过渡。

2.提示词2deepseek给出的回答

学习计划总表(4周速成)
周数 学习模块 每日安排(6-8小时) 关键目标
Week 1 编程基础+生物数据处理 上午:Python语法+NumPy/Pandas (3h)
下午:生物数据格式处理实战 (3h) 掌握VCF/FASTQ文件解析
完成GWAS基础分析
Week 2 机器学习+基因组学应用 上午:监督学习算法 (2h)
下午:生物特征选择实战 (4h) 实现SNP特征筛选模型
掌握SHAP值解释
Week 3 深度学习+蛋白质预测 上午:PyTorch框架 (3h)
下午:AlphaFold复现 (3h) 搭建简易蛋白质结构预测模型
理解Attention机制
Week 4 项目集成+求职准备 上午:端到端项目开发 (4h)
下午:技术文档编写+模拟面试 (2h) 完成基因型-表型预测系统
GitHub项目页+技术博客
详细每日计划表
Week 1: 编程基础+生物数据处理
日期 上午任务 (3h) 下午任务 (3h) 实践成果
D1 Python基础语法
-《Python Crash Course》第1-5章 Jupyter环境配置
NumPy数组操作练习 提交BMI计算器代码
D2 Pandas数据处理

  • 数据清洗/合并/分组聚合 解析FASTA文件
    统计GC含量 生成物种GC含量分析报告
    D3 Biopython实战
  • 处理GenBank格式数据 VCF文件解析
    使用PyVCF库筛选SNP 完成致病突变筛选脚本
    D4 Linux基础
  • 命令行操作
  • 批量处理测序文件 Bash脚本编写
    自动化数据预处理 创建NGS数据清洗Pipeline
    D5 SQL基础
  • 查询基因数据库
    (ENSEMBL/NCBI) 构建本地基因数据库
    MySQL表设计 存储100个植物基因数据
    D6 统计学强化
  • 假设检验
  • 曼哈顿图绘制 GWAS全基因组关联分析实战 发现3个显著关联位点
    D7 知识整合
  • 复盘代码
  • GitHub仓库初始化 开发基因序列分析工具包 GitHub首个生物信息工具库
    Week 2: 机器学习+基因组学应用
    日期 上午任务 (2h) 下午任务 (4h) 实践成果
    D8 监督学习基础
  • 吴恩达ML课程W1-W3 Scikit-learn实现
  • 决策树预测疾病风险 糖尿病风险预测模型(AUC>0.7)
    D9 特征工程
  • SNP数据编码
    (One-hot/Embedding) 使用PLINK进行特征筛选
    LASSO回归实战 筛选出50个关键SNP位点
    D10 集成学习
  • Random Forest
  • XGBoost 构建多基因风险评分模型 模型准确率提升15%
    D11 模型解释
  • SHAP/LIME原理 可视化基因特征重要性 生成特征贡献力热力图
    D12 无监督学习
  • PCA/t-SNE 群体遗传结构分析 发现3个亚群分类
    D13 深度学习入门
  • 全连接网络搭建 PyTorch实现
  • 基因表达量预测 RMSE<0.3的预测模型
    D14 知识整合
  • 优化模型
  • 撰写技术文档 部署模型到Flask API 可访问的疾病风险预测API
    Week 3: 深度学习+蛋白质预测
    日期 上午任务 (3h) 下午任务 (3h) 实践成果
    D15 PyTorch进阶
  • 自动微分
  • 自定义层 实现CNN分类
  • 蛋白质二级结构预测 准确率>65%的预测模型
    D16 序列模型
  • LSTM/GRU 基因序列编码预测
    (如启动子识别) 构建promoter识别器
    D17 Attention机制
  • Transformer架构 复现Geneformer部分功能 实现基因表达调控预测
    D18 AlphaFold解析
  • 多序列比对(MSA)
  • 结构评估 使用ColabFold预测小蛋白结构 生成3D结构PDB文件
    D19 图神经网络
  • GAT/GCN 构建PPI(蛋白质互作)网络 预测10组已知互作关系
    D20 模型压缩
  • 量化/剪枝 优化部署基因检测模型 模型体积缩小50%
    D21 知识整合
  • 模型对比实验
  • 技术博客写作 录制模型演示视频 发布Medium技术文章
    Week 4: 项目集成+求职准备
    日期 上午任务 (4h) 下午任务 (2h) 实践成果
    D22 端到端项目开发
  • 植物抗病基因筛选系统 编写单元测试
    优化代码结构 完整项目文档
    D23 部署优化
  • Docker容器化
  • AWS/GCP云端部署 压力测试
    性能监控 可访问的Web应用
    D24 生物竞赛实战
  • Kaggle开放式创新挑战 基因组数据挖掘 进入比赛前30%
    D25 简历重构
  • STAR法则描述项目
  • 量化成果 LinkedIn档案优化
  • 添加技术关键词 获得10+技术人脉
    D26 模拟面试
  • 刷LeetCode生物信息题库 行为面试准备
  • 故事线梳理 完成30道高频题
    D27 技术演讲准备
  • 制作项目PPT 录制5分钟演示视频 上传YouTube/Vimeo
    D28 最终复盘
  • GitHub页面美化
  • 技术博客SEO优化 申请岗位
  • 华大基因/药明康德/Illumina 提交3家目标企业申请
    关键学习资源
    编程基础

书籍:《Python生物信息学数据管理》(使用Biopython)
平台: DataCamp生物信息学专项课程
机器学习

课程: Coursera《基因组数据科学专项》(约翰霍普金斯大学)
工具: Google Colab Pro(获得V100 GPU)
深度学习

框架: PyTorch Lightning + PyTorch Geometric
论文: 《Nature Biotechnology》AI制药最新研究
备注
时间管理: 建议采用「番茄工作法」(25分钟专注+5分钟休息),每天保证6小时高效学习
求职加速: 同步参与GitHub开源生物信息项目(如CovidSeq分析),快速积累commit记录
风险预警: 实际达到岗位要求可能需要8-12周,本计划为强化速成版,建议后续持续深化NLP/多组学整合方向
(建议将每日代码同步至GitHub,技术博客发布在Medium/知乎专栏,形成完整能力证明链)

总结

Deepseek不仅给出了详细的职业规划,并将学习计划从每周细化到每天,是非常人性化的。并且Deepseek告诉我风险,实际达到岗位要求可能需要8-12周,可能急于求成,这确实是我需要考虑的事情。

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