
用Deepseek制定学习生信的学习计划,懂行的大佬给看下现不现实?
利用deepseek制定学习计划,从0开始学习生物信息学,向AI生物信息方向发展,今后希望可以按照这个计划坚持下来,看最后结果是怎样,懂行的大佬给看下这个计划可不可行?
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文章目录
- 前言
- 一、用deepseek-r1制定学习计划?
- 二、使用步骤
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- 1.提示词1后deepseek给出的回答:
- 2.提示词2deepseek给出的回答
- 框架: PyTorch Lightning + PyTorch Geometric 论文: 《Nature Biotechnology》AI制药最新研究 备注 时间管理: 建议采用「番茄工作法」(25分钟专注+5分钟休息),每天保证6小时高效学习 求职加速: 同步参与GitHub开源生物信息项目(如CovidSeq分析),快速积累commit记录 风险预警: 实际达到岗位要求可能需要8-12周,本计划为强化速成版,建议后续持续深化NLP/多组学整合方向 (建议将每日代码同步至GitHub,技术博客发布在Medium/知乎专栏,形成完整能力证明链)
- 总结
前言
利用deepseek制定学习计划,从0开始学习生物信息学,向AI生物信息方向发展,今后希望可以按照这个计划坚持下来,看最后结果是怎样。
一、用deepseek-r1制定学习计划?
提示词1:我本科是XX专业,硕士是林木遗传育种方向,主攻课题为基因定位,毕业后在市政绿化行业工作两年,目前已离职,目前想向AI行业或者机器人行业转行,请问有什么好的建议和规划吗?
提示词2:我计划用4周的时间,达到可以胜任生命科技公司AI部门(如华大基因、药明康德AI部门)的工作能力,请帮我列出详细的学习计划,并做成表格
二、使用步骤
1.提示词1后deepseek给出的回答:
根据你的背景和转行目标,以下是分阶段的详细规划建议:
一、核心优势定位
复合型知识结构:生物信息学(基因定位)+ 环境工程(市政绿化)+ AI/机器人
差异化竞争力:聚焦「生命科学×智能科技」交叉领域
可迁移技能:实验设计、数据分析、统计学应用、项目管理
二、AI领域转行路径
阶段1:基础建设(3-6个月)
编程基础:Python(NumPy/Pandas)+ SQL + Linux
数学补强:重点突破概率统计与线性代数
机器学习:吴恩达课程+《Hands-On ML》+ Kaggle入门
阶段2:垂直领域突破
生物信息学方向:
掌握Biopython/BCL等工具
参与基因组数据分析项目
学习AlphaFold等AI制药前沿
智慧农业方向:
研究精准农业中的CV应用
探索植物表型组学AI分析
开发生长预测模型
阶段3:实战验证
开发植物病害识别系统(CV应用)
构建基因型-表型预测模型
参加Kaggle生物数据竞赛
三、机器人领域转行路径
阶段1:知识重构(4-8个月)
基础课:自动控制原理+ROS系统
硬件基础:Arduino/树莓派开发
核心技能:SLAM导航+OpenCV
阶段2:场景化专精
农业机器人方向:
研究自动嫁接机器人
开发智能喷药系统
设计苗圃巡检机器人
生态机器人方向:
城市绿化监测无人机
自动修剪机器人
土壤分析机器人
阶段3:项目沉淀
搭建自动灌溉原型系统
改造开源农业机器人项目
参加RoboMaster等赛事
四、求职策略
目标企业类型:
生命科技公司(华大基因、药明康德AI部门)
农业科技企业(极飞科技、大疆农业)
智慧城市解决方案商
科研院所交叉学科组
简历优化重点:
突出多学科交叉背景
量化市政绿化项目成果
展示自主学习能力(GitHub/技术博客)
过渡期建议:
争取生物信息分析岗位作为跳板
参与智慧农业初创公司项目
报考农业/林业院校AI相关在职博士
五、风险控制
建立「双线发展」模式:保持原有领域深度同时拓展技术宽度
考取权威认证:AWS机器学习认证/NVIDIA DLI证书
加入垂直社群:AgFunder/农业机器人开发者联盟
建议优先考虑AI在生命科学领域的应用方向,你的基因研究背景可产生独特优势。当前农业AI人才缺口达67%(2023年工信部数据),且存在专业壁垒,是理想的转行切入点。初期可瞄准智慧农业企业的算法工程师岗位,逐步向核心AI岗位过渡。
2.提示词2deepseek给出的回答
学习计划总表(4周速成)
周数 学习模块 每日安排(6-8小时) 关键目标
Week 1 编程基础+生物数据处理 上午:Python语法+NumPy/Pandas (3h)
下午:生物数据格式处理实战 (3h) 掌握VCF/FASTQ文件解析
完成GWAS基础分析
Week 2 机器学习+基因组学应用 上午:监督学习算法 (2h)
下午:生物特征选择实战 (4h) 实现SNP特征筛选模型
掌握SHAP值解释
Week 3 深度学习+蛋白质预测 上午:PyTorch框架 (3h)
下午:AlphaFold复现 (3h) 搭建简易蛋白质结构预测模型
理解Attention机制
Week 4 项目集成+求职准备 上午:端到端项目开发 (4h)
下午:技术文档编写+模拟面试 (2h) 完成基因型-表型预测系统
GitHub项目页+技术博客
详细每日计划表
Week 1: 编程基础+生物数据处理
日期 上午任务 (3h) 下午任务 (3h) 实践成果
D1 Python基础语法
-《Python Crash Course》第1-5章 Jupyter环境配置
NumPy数组操作练习 提交BMI计算器代码
D2 Pandas数据处理
- 数据清洗/合并/分组聚合 解析FASTA文件
统计GC含量 生成物种GC含量分析报告
D3 Biopython实战 - 处理GenBank格式数据 VCF文件解析
使用PyVCF库筛选SNP 完成致病突变筛选脚本
D4 Linux基础 - 命令行操作
- 批量处理测序文件 Bash脚本编写
自动化数据预处理 创建NGS数据清洗Pipeline
D5 SQL基础 - 查询基因数据库
(ENSEMBL/NCBI) 构建本地基因数据库
MySQL表设计 存储100个植物基因数据
D6 统计学强化 - 假设检验
- 曼哈顿图绘制 GWAS全基因组关联分析实战 发现3个显著关联位点
D7 知识整合 - 复盘代码
- GitHub仓库初始化 开发基因序列分析工具包 GitHub首个生物信息工具库
Week 2: 机器学习+基因组学应用
日期 上午任务 (2h) 下午任务 (4h) 实践成果
D8 监督学习基础 - 吴恩达ML课程W1-W3 Scikit-learn实现
- 决策树预测疾病风险 糖尿病风险预测模型(AUC>0.7)
D9 特征工程 - SNP数据编码
(One-hot/Embedding) 使用PLINK进行特征筛选
LASSO回归实战 筛选出50个关键SNP位点
D10 集成学习 - Random Forest
- XGBoost 构建多基因风险评分模型 模型准确率提升15%
D11 模型解释 - SHAP/LIME原理 可视化基因特征重要性 生成特征贡献力热力图
D12 无监督学习 - PCA/t-SNE 群体遗传结构分析 发现3个亚群分类
D13 深度学习入门 - 全连接网络搭建 PyTorch实现
- 基因表达量预测 RMSE<0.3的预测模型
D14 知识整合 - 优化模型
- 撰写技术文档 部署模型到Flask API 可访问的疾病风险预测API
Week 3: 深度学习+蛋白质预测
日期 上午任务 (3h) 下午任务 (3h) 实践成果
D15 PyTorch进阶 - 自动微分
- 自定义层 实现CNN分类
- 蛋白质二级结构预测 准确率>65%的预测模型
D16 序列模型 - LSTM/GRU 基因序列编码预测
(如启动子识别) 构建promoter识别器
D17 Attention机制 - Transformer架构 复现Geneformer部分功能 实现基因表达调控预测
D18 AlphaFold解析 - 多序列比对(MSA)
- 结构评估 使用ColabFold预测小蛋白结构 生成3D结构PDB文件
D19 图神经网络 - GAT/GCN 构建PPI(蛋白质互作)网络 预测10组已知互作关系
D20 模型压缩 - 量化/剪枝 优化部署基因检测模型 模型体积缩小50%
D21 知识整合 - 模型对比实验
- 技术博客写作 录制模型演示视频 发布Medium技术文章
Week 4: 项目集成+求职准备
日期 上午任务 (4h) 下午任务 (2h) 实践成果
D22 端到端项目开发 - 植物抗病基因筛选系统 编写单元测试
优化代码结构 完整项目文档
D23 部署优化 - Docker容器化
- AWS/GCP云端部署 压力测试
性能监控 可访问的Web应用
D24 生物竞赛实战 - Kaggle开放式创新挑战 基因组数据挖掘 进入比赛前30%
D25 简历重构 - STAR法则描述项目
- 量化成果 LinkedIn档案优化
- 添加技术关键词 获得10+技术人脉
D26 模拟面试 - 刷LeetCode生物信息题库 行为面试准备
- 故事线梳理 完成30道高频题
D27 技术演讲准备 - 制作项目PPT 录制5分钟演示视频 上传YouTube/Vimeo
D28 最终复盘 - GitHub页面美化
- 技术博客SEO优化 申请岗位
- 华大基因/药明康德/Illumina 提交3家目标企业申请
关键学习资源
编程基础
书籍:《Python生物信息学数据管理》(使用Biopython)
平台: DataCamp生物信息学专项课程
机器学习
课程: Coursera《基因组数据科学专项》(约翰霍普金斯大学)
工具: Google Colab Pro(获得V100 GPU)
深度学习
框架: PyTorch Lightning + PyTorch Geometric
论文: 《Nature Biotechnology》AI制药最新研究
备注
时间管理: 建议采用「番茄工作法」(25分钟专注+5分钟休息),每天保证6小时高效学习
求职加速: 同步参与GitHub开源生物信息项目(如CovidSeq分析),快速积累commit记录
风险预警: 实际达到岗位要求可能需要8-12周,本计划为强化速成版,建议后续持续深化NLP/多组学整合方向
(建议将每日代码同步至GitHub,技术博客发布在Medium/知乎专栏,形成完整能力证明链)
总结
Deepseek不仅给出了详细的职业规划,并将学习计划从每周细化到每天,是非常人性化的。并且Deepseek告诉我风险,实际达到岗位要求可能需要8-12周,可能急于求成,这确实是我需要考虑的事情。
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